Laboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas – BioSistemas

Responsáveis

  • Mauro Antonio Alves Castro

Departamento/Setor vinculado

  • Educação Profissional e Tecnológica – SEPT

Localização

  • R: Doutor Alcides Vieira Arco-Verde, 1225 Curitiba – PR – 1225 CEP 81520-260

Contato

  • (41) 3361-4906
  • mauro.castro@ufpr.br

Serviços Prestados

O Laboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas da UFPR desenvolve métodos computacionais, estatísticos e matemáticos aplicados a problemas biológicos.

  • Análises de dados genômicos;
  • Reconstrução de redes regulatórias;
  • Análise de dados de RNA-seq;
  • Análise de enriquecimento funcional;
  • Extração de características;
  • Reconhecimento de padrões.

Principais Equipamentos

O ambiente de pesquisa está organizado em 4 laboratórios temáticos e espaço multiusuário. O Laboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas ocupa uma área de 30m2 (Sala B09)

  • Duas (2) Estações de Trabalho Intel® Xeon Silver 4216, 32 núcleos, 192 GB DDR4 e GPU de alto desempenho;
  • Duas (2) Estações de Trabalho Intel® Xeon E3-1230 V6, 32GB DDR4;
  • Uma (1) Estação de Trabalho Intel® Xeon E5-1620 v4, 48 GB DDR4.
  • Além disso, conta com uma Sala de Servidores com infraestrutura para computação de alto desempenho, com sala climatizada e infraestrutura de rede de alta velocidade. 

Equipe Vinculada ao Laboratório

  • Prof. Dr. Mauro Antônio Alves Castro
  • Prof. Dr. Dieval Guizelini

Palavras-Chave 

  • Bioinformática, análise de dados, mutações somáticas, variantes genéticas, redes transcricionais, oncogenômica, câncer
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